В период налогового мониторинга не проводятся камеральные и выездные проверки. Исключением для проведения камеральной проверки может стать только досрочное прекращение налогового мониторинга. выездные проверки могут провести в случае организации проверки инспекции, проводившей мониторинг, вышестоящим налоговым органом; при досрочном прекращении налогового мониторинга; при невыполнении мотивированного мнения в срок до 1 декабря года, следующего за годом налогового мониторинга, а также если организация подала уточненную налоговую декларацию за период налогового мониторинга, где отразила уменьшение суммы налога к уплате в бюджет, увеличение возмещения суммы НДС или акциза, либо увеличение полученного убытка (п. 1.1, ст. 88 НК РФ в редакции Федерального закона от 29.12.2020 года № 470-ФЗ).