Просьба дать  пояснения: в каких случаях использовать подпись в формате "<UUID>.bin", а в каких *.SGN.
Пока однозначно понятно, что все документы в формате XML требуется подписывать  *.bin.
УКЭП в формате "<UUID>.bin", или *.SGN нужно использовать, если в ответ на требование приложены, например:
- счет-фактура в формате PDF?
 - счет-фактура в формате JPG?
- акт-выполненных работ в формате PDF?
 - договор в формате PDF? 
Подпись с расширением bin всегда должна быть под каждым документом в ТК. Подпись с расширением sgn может быть только у приложения, она добавляется в ТК если документ ранее отправлялся через другую систему и там был подписан ЭП. 
Значение UUID не связано с подписанным файлом. Имя файла подписи формируется: Используемые универсальные уникальные идентификаторы должны генерироваться согласно общим принципам формирования UUID version 1, изложенным в документе RFC 4122 (http://www.ietf.org/rfc/rfc4122.txt). Универсальные уникальные идентификаторы представляются в виде шестнадцатеричного числа из 32 разрядов, записанного в нижнем регистре.
Если ответ на направленный документ (протокол, СОШ), то это новый вызов. В самом протоколе будет содержаться идентификатор документооборота, на который отправляется протокол, в имени СОШ так же имеется ключ в виде TicketId, повторяющий TicketId  вызова метода по передачи контейнера с документом, на который потом формируется СОШ. Ожидается что каждый новый вызов метода новый тикет.
Да, правильно - обращение происходит через SPVDOC.
Поле НаимДок в случае невозможности представления документа заполняется из пункта требования.
Повторный запрос не предусматривается.
Необходимо заполнить все поля, предусмотренные сервисом №4.
Сервис используется только для просмотра электронных образов документов, связанных с исчислением (удержанием), уплатой (перечислением) налогов, сборов, страховых взносов и размещенных в ИС НП допустимых форматов.
Налоговые регистры не подлежат просмотру налоговым органом путем вызова сервиса 5, не предоставление налоговых регистров для просмотра не может послужить основанием для досрочного прекращения НМ. 
В ЭХД подлежат размещению документы, связанные с исчислением (удержанием), уплатой (перечислением) налогов, сборов, страховых взносов предусмотренные Приложением №9 к РИВ, утв.  приказом ФНС России от 11.05.2021 № ЕД-7-23/476. Ограничения по сроку наполнения ЭХД отсутствуют.
Да. В реестре документов должны быть отражены все документы (в ЭАИС или посредством доступа к витрине НМ посредством интеграционного модуля), указанные в приложении № 9 к РИВ.

Вашего вопроса нет в списке?

Напишите нам, и мы постараемся оперативно на него ответить.

Хотите быть в курсе всех событий и получать уведомления о предстоящих мероприятиях?
Тогда подпишитесь на нашу рассылку